这是一份来自伦敦皇家 Brompton and Harefield 国民保健服务信托基金会 Freidin 的报道,发表在近期的 Clinical Chemistry 上。本文用于评价胸部恶性肿瘤的 KRAS 突变检测中,不同样本孰优孰劣。
循环标志物,比如循环肿瘤细胞(CTCs)和循环肿瘤 DNA (ctDNA)常用于血液突变检测。CTCs和ctDNA 可以提供肿瘤来源的基因信息。作为液态活检样本,它们的检测和分子特征,已是肿瘤转化研究中最为活跃的领域。CTCs最大的优势是 DNA 具有完整性,而ctDNA是降解的 DNA 片段。然而由于肿瘤异质性,CTCs无法在脱离微环境后充分展示原发肿瘤的分子特征,而且其捕获依然困难重重。而ctDNA可以展示原发肿瘤所有的突变,而痕量即可供临床检测 (1–100 ng/mL) 。但是对两者进行平行比较的研究较少。
本研究通过检测肺癌手术病人的 KRAS 突变,来比较血液中CTCs和ctDNA在突变筛查中的特异性和敏感性。
方法:该研究招募了 93 位病人,其中包括 82 位肺癌患者和 11 位肺部良性疾病患者。使用低变性温度PCR 技术(COLD-PCR)、高分辨熔解技术(HRM)和商业化检测(罗氏Cobas ® KRAS突变检测)对CTCs、血浆、肿瘤或者肺组织,进行 KRAS 基因密码子 12 和 13 的突变检测。
结果:商业化突变检测结果显示,肿瘤组织中,有 21.3% 的 KRAS 突变率。
由 COLD-PCR/HRM 检测出肺癌患者CTCs DNA 和ctDNA突变率分别为 30.5% 和 23.2%。结合不同检测方法的结果得到肿瘤中 KRAS 阳性率为 28%。使用ctDNA检测 KRAS 突变的敏感性和特异性分别达到 0.96(95% CI 0.81–1.00) 和 0.95(0.85– 0.99),而CTCs DNA 检测的敏感性和特异性较低,分别为 0.52 和 0.88。
结论:本研究提示,在胸部肿瘤检测中,相较CTCs DNA 或者有限的肿瘤组织,ctDNA可作为突变筛查优先选择的样本类型。