甲胎蛋白（AFP）是原发性肝癌和生殖系肿瘤生物标志物。正常参考值为 0～15 ng/mL。
AFP 诊断肝癌的临床性能
AFP 是早期诊断原发性肝癌最敏感、最特异的指标，适用于大规模普查。如果成人血 AFP 值升高，则表示有患肝癌的可能。
70%～95% 原发性肝癌患者的 AFP 升高，越是晚期，AFP 含量越高。见过几个原发性肝癌的患者，AFP 检查都已经达到极值了。在转移性肝癌中，AFP 值一般低于 350～400 ng/mL。
AFP 阴性并不能排除原发性肝癌。
AFP 水平在一定程度上反应肿瘤的大小，其动态变化与病情有一定的关系，是显示治疗效果和预后判断的一项敏感指标。
AFP 值异常高者一般提示预后不佳，其含量上升则提示病情恶化。通常手术切除肝癌后二个月，AFP 值应降至 20 ng/mL 以下，若降的不多或降而复升，提示切除不彻底或有复发、转移的可能。
肝癌的血清标志物
AFP：无肝病活动、排除妊娠和生殖腺胚胎癌，≥400 ng/mL 持续 1 月或 ≥ 200 ng/mL 持续 2 月者，结合影像检查可诊断肝癌。
GP37：预测早期肝癌最有前景。
CK19：AFP阴性肝癌早期诊断 敏感度 50%、特异度 90.9%。
CEA+AFP+CA125：敏感度可达 95.83%。
AFP 与其他疾病（非肝癌）
妇产科的生殖腺胚胎癌、卵巢内胚窦癌 AFP 也会明显升高。
AFP 中度升高也常见于酒精性肝硬化、急性肝炎以及 HBsAg 携带者。
某些消化肿瘤也会出现 AFP 升高现象。
孕妇血清或羊水 AFP 升高提示胎儿脊柱裂、无脑症、食管 atresia 或多胎，AFP 降低 (结合孕妇年龄) 提示未出生的婴儿有 Down’s 综合征的危险性。